El mismo aislamiento de las islas que produjo la diversificación de las especies, supone también un riesgo para las mismas. La llegada de nuevos colonizadores puede desencadenar cambios dramáticos dentro de la frágil ecología de Galápagos.
A partir de 1535 el hombre empezó a intervenir en el balance natural del archipiélago. Con sus barcos llegaron nuevas especies (de forma voluntaria o involuntaria) en un número y variedad imposibles de absorber dentro del equilibrio natural de las islas.
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